Aunque los asentamientos humanos en estas tierras son muy antiguos, como se puede ver en los yacimientos arqueológicos de Majadaiglesia, es en la Edad Media cuando se funda la población de El Guijo. El municipio se encuentra a 100 km de la capital y su extensión es de 67 km2 a una altitud de 567m sobre el nivel del mar. Sus habitantes son 406.
Fue en el siglo XIV cuando El Guijo surgió como aldea de Pedroche, que entonces rezaba como capital del valle. A partir de la reconquista, pasa a depender de la jurisdicción de Córdoba, hasta 1492, en que los Reyes Católicos rigieron unas ordenanzas para el Valle de los Pedroches.
A finales del siglo XVI todos los pueblos del valle pasan a depender del marqués del Carpio y esta situación durará dos siglos. En 1747 las villas del Valle de Los Pedroches son incorporados a la corona.
Ha sido villa del señorío de Santa Eufemia durante toda la edad moderna y fue el centro de recaudación del derecho de pasto.
